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　　功夫：2024-04-22 14:22根源：中国农业科学院北京畜牧兽医磋商所作家： 陈燕原文:

　　中心提示：指日，中国农业科学院北京畜牧兽医磋商所牛遗传育种科技更始团队开采了一款肉牛基因组抉择育种液体缉捕芯片“Cattle110K”。该芯片动作一款高效、经济的基因型检测行使器材，正在更始团队肉牛分子育种行使工夫的援帮下，将有力饱动我国肉牛遗传改进过程，帮力我国肉牛种业和家当一连高质料繁荣。相干磋商成效揭晓正在《Animal Research and One Health》上。

　　指日，中国农业科学院北京畜牧兽医磋商所牛遗传育种科技更始团队开采了一款组抉择育种液体缉捕芯片“Cattle110K”。该芯片动作一款高效、经济的基因型检测行使器材，正在更始团队肉牛分子育种行使工夫的援帮下，将有力饱动我国肉牛遗传改进过程，帮力我国肉牛种业和家当一连高质料繁荣。相干磋商成效揭晓正在《Animal Research and One Health》上。

　　低本钱、大范畴的基因分型工夫对牲畜的分子育种磋商至闭厉重。近年来，肉牛高密度SNP芯片（Illumina BovineHD Bead Chip）和中密度SNP芯片（Illumina Bovine SNP50 Bead Chip）被寻常行使于全基因组相干理解（GWAS）、基因组抉择（GS）等磋商中。然而，古代的磁珠芯片仅能检测已知的SNP而无法展现新的变异位点。二代测序可能检测到所有基因组中的全部变异，但对待分子育种范围的大范畴基因分型来说，代价照旧过于高贵。靶向缉捕测序工夫（GBTS）为这一题目供应清晰决计划，该工夫将芯片和二代测序的所长勾结起来，拥有低本钱、高确实度和计划敏捷等特征。本磋商基于GBTS工夫，开采了一款针对肉牛的液相缉捕芯片Cattle110K，评估了正在实质样本中的分型呈现以及正在GWAS磋商中的行使效益，同时对这款芯片和肉牛高密度芯片的遗传评估确实性实行了对照。

　　正在Cattle110K芯局部板计划阶段，更始团队正在肉牛厉重经济性状候选基因审定发掘和全基因组抉择工夫行使磋商的基本上，从GWAS，BayesB，eQTL-mapping，ATAC-seq等本领筛选的候选功效变异中，挑选出该芯片的倾向单核苷酸多态性位点，历程参考基因组版本转换、位点评估和样本测试，最终保存112180个基因检测位点，相邻SNP标帜均匀间距为22.15Kb，测试样本中最幼等位基因频率均值为0.32，反复样本基因型一律率为99.21%，与Illumina肉牛高密度芯片之间的一律率均匀为98.17%。

　　为验证Cattle110K实质行使效益，更始团队对国表里厉重肉牛种类实行了测试，并正在华西牛群体中发展全基因组相干理解以及体尺和屠宰性状的全基因遗传评估确实性的磋商。此中，正在肉牛厉重经济性状（宰前活重、胴体长、十字部高和大理石斑纹评分）的GWAS理解结果中，审定到6号染色体与宰前活重明显相干的基因组区域（NCAPG-LCORL），正在13号染色体和8号染色体上折柳找到与十字部高和大理石斑纹评分相干的新的候选基因组区域。正在全基因组抉择行使方面，Cattle110K正在基因组预测方面拥有与BovineHD相当的机能，正在宰前活重、屠宰率等上性状，该芯片基因组估摸育种值的（GEBV）确实性再有所进步。

　　磋商结果解说，Cattle110K芯片蕴涵肉牛厉重经济性状相干位点，位点分散平均，分型确实性高，性价比好。采用该芯片对实质样本实行基因分型展现，正在GWAS和GS的理解中都拥有较高的牢靠性和确实性。Cattle110K为肉牛育种供应了一个高效、经济的基因分型器材，将有帮于加快肉牛遗传改进的过程，有力维持肉牛基因组抉择工夫的实行行使。

　　牧医所陈燕副磋商员以及博士生郭应威、葛菲为该著作的协同第一作家，李俊雅磋商员和陈燕副磋商员为通信作家。该磋商取得国度肉牛牦牛家当工夫系统和中国农业科学院科技更始工程等项目协同资帮。

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